3-indoletiķskābe ir sava veida augu auksīns. Auksīnam ir daudz fizioloģisku efektu, kas ir saistīti ar tā koncentrāciju. Zema koncentrācija var veicināt augšanu, un augsta koncentrācija kavēs augšanu, pat iznīcinot augus. Šī inhibējošā iedarbība ir saistīta ar to, vai tā var izraisīt etilēna veidošanos. Auksīna fizioloģiskā iedarbība izpaužas divos līmeņos. Šūnu līmenī auksīns var stimulēt kambija šūnu dalīšanos; stimulēt zaru pagarinājumu un kavēt sakņu šūnu augšanu; veicina ksilēma un flīma šūnu diferenciāciju, veicina spraudeņu sakņu veidošanos un regulē kalusa morfoloģiju. Orgānu un visa auga līmenī auksīns darbojas no stādiem līdz augļu nogatavināšanai. Auksīns kontrolē atgriezenisko sarkanās gaismas inhibīciju hipokotila pagarinājumā stādos; kad tas pāriet uz dzinumu apakšpusi, tas rada zaru ģeotropismu; kad tas pāriet uz dzinumu aizmugures apgaismojuma pusi, tas rada zara fototropismu; 3-indoletiķskābe rada apikālu priekšrocību un aizkavē lapu novecošanu. Auksīns veicina ziedēšanu, izraisa partenokarpu augļu attīstību un aizkavē augļu briedumu.